Le fosfodiesterasi sono una famiglia delle fosfoidroliasi che catalizzano selettivamente l’idrolisi del legami fosfati ciclici in posizione 3′ nella cAMP e/o cGMP (3,5-ciclomonofosfatoadenosina e 3,5-ciclomonofosfatoguanina).
Queste proteina partecipano ai processi di trasmissione e amplificazione dei segnali visivi attraverso il nervo ottico. E’ necessaria per la formazione delle Fosfodiesterasi che sono oloenzimi. Come accezione generale un oloenzima in enzimologia è la parte cataliticamente attiva di un enzima comprensiva della sua parte prostetica (cofattori e coenzimi, i primi inorganici i secondi di natura organica) e di eventuali subunità funzionali proteiche.
Esse regolano il livello cellulare, la localizzazione e la durata dell’azione di questi messaggeri secondari controllando il loro stato di degradazione. Esistono 11 sottotipi di PDE, definiti come: PDE1-11.
PDE4, 7 e 8 degradano selettivamente la cAMP
PDE5, 6 e 9 degrada selettivamente cGMP
PDE1, 2, 3, 10 e 11 degradano i nucleotidi ciclici
la PDE sono espresse ubiquariamente ed ogni sottotipo ha uno specifica distribuzione sui tessuti.
Questi enzimi sono presenti in molti percorsi inerenti la trasduzione del segnale e le loro funzioni includono anche l’accrescimento e la contrazione muscolare, l’elasticità cardiaca, la secrezione ormonali, l’attivazione delle difese cellulari e sono presenti anche nei processi di apprendimento e memorizzazione.
La mutazione del rd1 nel gene Pbe6b porta alla perdita delle subunità Beta del 3,5-ciclomonofosfatoguanina fosfodiesterasi ed eventualmente di tutti i fotorecettori (coni e bastoncelli).
Uno studio del 1999 suggerisce che alcuni farmanci antagonisti del del canale Ca2+, ritardino la cinetica degenerativa dei bastoncelli rd1 conferendo un parziale recuopero della visione, nei casi di retinopatia.
| Protein type: Phosphodiesterase; EC 3.1.4.35 |
| Cellular Component: membrane; cytosol |
| Molecular Function: 3′,5′-cyclic-GMP phosphodiesterase activity; phosphoric diester hydrolase activity; hydrolase activity; metal ion binding |
| Biological Process: phototransduction, visible light; platelet activation; detection of light stimulus; cytosolic calcium ion homeostasis; visual perception; retina development in camera-type eye; response to stimulus; signal transduction; blood coagulation; GMP metabolic process |
| Reference #: P35913 (UniProtKB) |
| Alt. Names/Synonyms: CSNB3; CSNBAD2; GMP-PDE beta; PDE6B; PDEB; phosphodiesterase 6B, cGMP-specific, rod, beta; rd1; rod cGMP-phosphodiesterase beta-subunit; Rod cGMP-specific 3′,5′-cyclic phosphodiesterase subunit beta; RP40 |
| Gene Symbols: PDE6B |
| Molecular weight: 98,336 Da |
| Basal Isoelectric point: 5.11 Predict pI for various phosphorylation states |
Sequenza non formattata
MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVAAACEDGCPPDCDSLRDL
CQVEESTALLELVQDMQESINMERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQR
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CCIL
Bibliografia
Genatlas
Genbank
Nucleic Acids Res. 2006 Jul 1;34(Web Server issue):W119-23.
Protein Block Expert (PBE): a web-based protein structure analysis server using a structural alphabet.
Tyagi M, Sharma P, Swamy CS, Cadet F, Srinivasan N, de Brevern AG, Offmann B
Lawton M, Trottier Y, Lehrach H, Davies SW, Bates GP. Exon 1 of the HD gene with
an expanded CAG repeat is sufficient to cause a progressive neurological
phenotype in transgenic mice. Cell. 1996 Nov 1;87(3):493-506.
Azadi S, Johnson LE, Paquet-Durand F, Perez MT, Zhang Y, Ekström PA, van Veen
T. CNTF+BDNF treatment and neuroprotective pathways in the rd1 mouse retina.
Brain Res. 2007 Jan 19;1129(1):116-29. Epub 2006 Dec 6.
Alvarez-López C, Cernuda-Cernuda R, García-Fernández JM. The mPer1 clock gene
expression in the rd mouse suprachiasmatic nucleus is affected by the retinal
degeneration. Brain Res. 2006 May 4;1087(1):134-41. Epub 2006 Apr 13.