Il pH citoplasmatico si aggira tra il 7 ed il 7,4 è quindi leggermente basico, sia nelle cellule animali sia nelle vegetali. Questo non vale per il contenuto del vacuolo, che può raggiungere anche valori fortemente acidi. I fosfati ed i composti azotati presenti nel citoplasma formano un ottimo sistema che tampona le variazioni di pH.