Salve a tutti… volevo sapere la differenza nell’utilizzo di microarray oligonucleotidici 25omeri e 60meri. Grazie

La tecnica dei microarray o matrici ad alta densità serve per l’analisi in parallelo e su vasta scala di sequenza di geni e della loro espressione. Invece di studiare un gene singolarmente, si può analizzare contemporaneamente l’espressione di migliaia di geni, usando delle sonde attaccate alla superficie di vetrini da microscopio.

Per maggiori approfondimenti sulla tecnica del microarray:
http://www.biogate.it/microarrays/microarrays.html
http://www.vialattea.net/esperti/php/risposta.php?num=10733
http://it.wikipedia.org/wiki/Microarray

Gli array di oligonucleotidi lunghi sono composti di 60-meri (oligo costituiti d 60 basi) gli arrays di oligonucleotidi corti sono composti di 25-meri.

Il formato da 60-meri dà una maggiore sensibilità rispetto al formato di 25-meri in parte a causa della maggiore area disponibile per la ibridazione. Inoltre i 60-meri risentono meno delle sequenze non corrispondenti e così sono più adatti per l’analisi delle regioni ad alto polimorfismo.

In Inglese:
http://www.chem.agilent.com/temp/radB529C/00042209.pdf
http://www.biotech-online.com/pdf/10700.pdf
http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=1214658
http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=484198&tools=bot
http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=1214658